人类
EMBL(EMBL nucleotide sequence database EMBL核苷酸序列数据库)
DDBJ(DNA Data Bank of Japan 日本DNA数据库)
GenBank(GenBank 基因序列数据库)
MIM(Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) 人类孟德尔遗传网上数据库)
Lawrence Berkeley Human Genome Informatics
小鼠
MGD(Mouse genome database 小鼠基因组数据库)
斑马鱼
ZFIN(Zebrafish Information Network genome database 斑马鱼信息网基因组数据库)
果蝇
FlyBase(Drosophila genome database 果蝇基因组数据库)
植物
MaizeDB(Maize genome database 玉米基因组数据库)
MAIZE-2DPAGE(Maize genome 2D Electrophoresis database 玉米基因组双向电泳数据库)
Mendel(Mendel-GFDb (Plant genes families database) 孟德尔植物基因家族数据库)
真菌
Delection (酵母功能基因组)
SGD(Saccharomyces Genome Database 酵母基因组数据库)
DictyDb(Dictyostelium discoideum genome database Dictyosteliumdiscoideum基因组数据库)
细菌
大肠杆菌
ECO2DBASE(Escherichia coli gene-protein database (2D gelspots) 大肠杆菌基因-蛋白数据库)
EcoCyc(Encyclopedia of E.coli genes and metabolism 大肠杆菌基因和代谢百科全书)
EcoGene(Escherichia coli K12 genome database Escherichia coliK12基因组数据库)
枯草杆菌
NRSUB(Non-redundant B.subtilis database 无冗余枯草杆菌数据库)
SubtiList(Bacillus subtilis 168 genome database 枯草杆菌168基因组数据库)
TIGR(The bacterial database(s) of 'The Institute of GenomeResearch' 基因组研究所的细菌数据库)
分支结核杆菌
TubercuList(Mycobacterium tuberculosis H37Rv genomedatabase分支结核杆菌H37Rv基因组数据库)
病毒
HIV(HIV sequence database HIV序列数据库)
综合基因数据库
PRESAGE(Collaborative resource for structural genomics 结构基因组学联合资源)
IMGT(ImMunoGeneTics db 免疫基因标记数据库)
KEGG (基因相互作用)