细菌RNA快速提取试剂盒

细菌RNA快速提取试剂盒

价格:1,100

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产品信息

 

产品名称

产品编号

规格

细菌RNA快速提取试剂盒

HRN0496

50T

 

产品描述

 

      独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶,然后用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。

 

产品组分

 

试剂盒组成

保存

50 T

TE (PH8.0)

室温

6 mL

溶菌酶

4℃

20 mg

裂解液RLT

室温

50 mL

去蛋白液RW1

室温

40 mL

漂洗液RW

室温

10 mL第一次使用前按说明加指定量乙醇

RNase-free H2O

室温

10 mL

RNase-free 吸附柱RA和收集管

室温

50套

本试剂盒在室温储存 12 个月不影响使用效果。

储存事项:

1.所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。

2.不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。

3.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

产品特点

 

1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。

2.不需要使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

3.快速,简捷,单个样品操作一般可在30分钟内完成。

4.多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.9~2.0,基本无DNA残留,可用于RT-PCR,Northern-blot和各种实验。

 

运输和保存方法

 

1)本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。

2)避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

注意事项

 

1.所第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量乙醇,加入后请及时打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!

2.所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。

3.需要自备乙醇。

4.裂解液RLT和去蛋白液RW1中含有盐酸胍/异硫氰酸胍化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

5.预防RNase 污染,应注意以下几方面:

1)经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase 污染。

2)使用无RNase 的塑料制品和枪头避免交叉污染。

3)RNA在裂解液RLT中时不会被RNase 降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase 的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4 小时,塑料器皿可在0.5 M NaOH 中浸泡10 分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。

4)配制溶液应使用无RNase 的水。(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1%( v/v),37℃放置过夜,高压灭菌。)

6.关于DNA 的微量残留:

一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留,本公司的RNA提取产品,由于采取了本公司独特的缓冲体系和选择了特殊吸附能力的吸附膜,在大多数RT-PCR 扩增过程中极其微量的DNA残留(一般电泳EB染色紫外灯下观察不可见)影响不是很大, 如果要进行严格的mRNA表达量分析如荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:

1)选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接,这样DNA就不能作为模板参与扩增反应。

2)选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。

3)将RNA提取物用RNase-free的DNase I 处理以提高效果。本试剂盒还可以用于DNase I处理后的RNA清洁(cleanup)。

4)在步骤去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上进行DNase I处理。

7.RNA 纯度及浓度检测:

完整性:RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳 (电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150v,15 分钟)检测完整性。由于细菌中70%-80%的RNA 为rRNA,电泳后UV 下应能看到非常明显的rRNA 条带。 细菌rRNA 大小分别约为5 kb 和2kb,分别相当于26S 和13S rRNA。细菌RNA 样品中最大rRNA 亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0 倍,否则表示RNA 样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。

纯度: OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的参考指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数(10mMTris, pH7.5)在2.1-2.2 之间(100%纯的RNA比值一般是2.2左右,很多公司无法达到这个标准,所以1.9-2.0就凑合用了,但是我们的产品标准一般可以达到2.1-2.2)。OD260/OD280 读数受测定所用溶液的pH 值影响。同一个RNA 样品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中测出的OD260/OD280读数1.8-2.1 之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9 之间,但这并不表示RNA 不纯。

浓度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水稀释n 倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260, OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/μL)= (OD260)×(稀释倍数n)×40。

8.本产品仅作科研用途!

使用方法

 

提示:

→第一次使用前请先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇!

→提取细菌RNA需先配制加了溶菌酶或者lysostaphin的TE(10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA),TE中已加入溶菌酶或者lysostaphin,浓度为1mg/mL。

1.离心收集1-2mL菌液(108-109细胞)到一个1.5 mL离心管, 尽可能去除上清,注意残留的上清不能超过20μL/每使用100μL TE(见下面步骤2)。

2.根据细胞的种类和数量,充分重悬细胞在100μL(5×108细胞)/ 200μL(5×108-7.5×108细胞) TE中(10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA),TE中已加入溶菌酶或者lysostaphin,浓度为1mg/mL,或者直接用TE重悬后,用干净枪头挑取少许溶菌酶加入。

3.室温(15-25℃)温育5分钟/溶菌酶, 或者37℃温育15分钟/ lysostaphin,破解细胞壁。每2分钟涡旋振荡10秒帮助破壁。

注意各种细菌破壁的难易程度不一样,一般革兰氏阴性菌使用上面的条件就足够了,甚至可能省略该步骤,但是某些阳性难破壁需要提高溶菌酶浓度或者使用lysostaphin,玻璃珠机械破壁,蛋白酶K消化或者联合使用等方法, 需要根据用户自己的具体情况调节酶的工作浓度和温育温度、时间和选择正确的方法。

4.加入350μL(如果上面使用100μL TE/酶)或者700μL(如果上面使用200μL TE/酶)裂解液RLT,吹打混匀后用手剧烈振荡20秒,充分裂解。

一般加入裂解液后充分涡旋吹打后应该见不到明显团块或者不溶物,极少数情况下如果有明显团块或者不溶物可以将裂解物13,000rpm离心3分钟,沉淀不能裂解的碎片或者不溶物,将裂解物上清全部转到一个新离心管再进行下一步。

5.加入250μL 无水乙醇(曾加入100μL TE/350μL RLT管)或者500μL无水乙醇(曾加入200μL TE/700μL RLT管),立即吹打混匀。

6.立刻将混合物(每次小于700μL,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心30秒,弃掉废液。

7.加700μL 去蛋白液RW1,室温放置30秒,13,000rpm 离心30秒,弃掉废液。如果DNA残留明显,可在加入RW1后室温放置5分钟再离心。

8.加入500μL漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),13,000 rpm离心30秒,弃掉废液。加入500μL漂洗液RW,重复一遍。

9.将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

10.取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μL RNase free water, 室温放置1分钟,13,000 rpm 离心1分钟。

11.如果预期RNA产量>30μg,加30-50μL RNase free water重复步骤10,合并两次洗脱液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。

洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。裂解液RLT Plus。最大处理量不超过107个细胞。

 

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